При Хрущеве проходит последняя в СССР активная антирелигиозная кампания — прежде всего против Русской православной церкви. Закрывают свыше 4 тыс. храмов, священников и верующих вытесняют в положение маргиналов, доживающих свой век

Искоренения религии как пережитка Хрущев, очевидно, считает частью продвижения страны к коммунизму. В горячем натиске кампании сказывается характер правителя, который не раз публично говорил про «религиозный дурман» и вскоре даст знаменитое обещание показать по телевидению «последнего попа». В 1958-м, когда Хрущев официально стал единоличным лидером — главой партии и правительства, одно за другим выходят постановления ЦК о недостатках атеистической пропаганды, «О мерах по прекращению паломничества к так называемым “святым местам”», решения Совета министров о монастырях и о налогообложении епархиальных предприятий и монастырских доходов. Обителям запрещают применять наемный труд, их земельные наделы сокращают, восстанавливают отмененный в 1945-м налог со строений, вдвое повышают налоговые ставки на храмовые участки (включая кладбища внутри церковной ограды) и на свечные мастерские. Вновь запрещают колокольный звон, разрешенный в 1941-м. В библиотеках изымается «литература религиозной тематики».

О былом перемирии с церковью забыто — видимо, как о сталинском «перегибе». Провозглашая борьбу с религией вообще, Кремль, однако, не смеет закрывать мечети, опасаясь «реставрации басмачества». Ликвидация православных приходов, как правило, сопротивления не вызывает. Без эксцессов закроют даже Киево-Печерскую лавру. Верующие отстоят только Речульский монастырь в Молдавии — одного его защитника милиция застрелит, пятерых ранит. И еще архимандрит Алипий не подчинится приказу о роспуске братии Псково-Печерского монастыря. Патриарх Алексий I просит о встрече с Хрущевым, но ответа не получает, а глава Отдела внешних церковных сношений митрополит Николай, заявляющий о «явной линии на уничтожение церкви», отправлен на пенсию.

С началом «космической эры», особенно после полета Гагарина, глумливая сатира госпропаганды шельмует христианскую веру как «антинаучный предрассудок».